Le service de microbiologie du laboratoire d'analyse de l'eau potable recherche les germes dans l'eau potable. Cette opération consiste à compter pour chaque germe le nombre d'unités formant colonies.
Les bactéries Escherichia coli et les entérocoques sont des germes importants pour la digestion humaine. Mais comme, lors d'analyses de l'eau potable, ils mettent en évidence une contamination fécale, ils ne doivent pas être présents dans l'eau potable.
Si des germes fécaux s’infiltrent dans l'eau potable d'une région suite à une inondation ou d'autres perturbations, il faut faire bouillir l'eau destinée à des fins alimentaires ou être remplacée provisoirement par de l'eau minérale. La plupart des distributeurs d'eau surveillent l'eau et sont capables de détecter rapidement une contamination microbienne à la source, sans laisser l'eau polluée arriver jusqu'au réseau. L'eau est aussi épurée pour éliminer les germes.
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